сарбековирус что такое простыми словами
У летучих мышей в Великобритании выявили новый коронавирус
Неизвестный ранее сарбековирус RhGB01, относящийся к коронавирусам, обнаружили у подковообразных летучих мышей в Сомерсете, Монмутшире и Уэльсе в Великобритании. Результаты работы опубликованы в журнале Scientific Reports.
В ходе исследования ученые из Университета Восточной Англии собирали фекалии десятков мелких летучих мышей, затем провели секвенирование генома, и в одном из 53 образцов нашли новый вирус.
Сарбековирус RhGB01 содержит 10 кодирующих генов, SARS-CoV и SARS-CoV-2 — 11 кодирующих генов с включением белка ORF8. При этом вирус относится к подгруппе, в которой в том числе присутствует SARS-CoV, вызвавший вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, и SARS-CoV-2, ставший причиной нынешней пандемии.
Основным рецептором для проникновения SARS-CoV и SARS-CoV-2 в организм является фермент АСЕ2 за счет рецептор-связывающего мотива (RBM) внутри рецептор-связывающего домена (RBD) S-белка.
Пока ученые не считают, что вирус способен передаваться человеку. В частности, RBD организма не совместим с человеческими клетками. Однако, как предупредили исследователи, ситуация может измениться в будущем, потому что любая летучая мышь, являющаяся переносчиком подобной атипичной пневмонии, может превратиться в «котел» для мутаций.
В частности, обеспокоенность среди биологов вызывает риск инфицирования летучей мыши сразу и RhGB01, SARS-CoV-2. Если животное с RhGB01 заразится SARS-CoV-2, есть риск, что эти вирусы будут гибридизоваться, в результате может появиться новый, который будет обладать способностью заражать людей.
Новый сарбековирус летучих мышей, похожий на SARS-CoV-2, безопасен для человека
На территории Великобритании обнаружен новый коронавирус подрода сарбековирусов, который заражает летучих мышей-подковоносов. Аминокислотная последовательность рецепторсвязывающего домена S-белка нового вируса (за исключением наиболее важного его участка — рецепторсвязывающего мотива RBM) на 77% и 81% гомологична таковой у SARS-CoV-2 и SARS-CoV соответственно. Тем не менее, вирус неспособен взаимодействовать с рецептором ACE2 клеток человека и потому не может стать возбудителем зоонозной инфекции, если не подвергнется очень существенным изменениям.
На данный момент естественным резервуаром коронавирусов подрода Sarbecovirus, к которому относятся SARS-CoV-2 и SARS-CoV, считаются летучие мыши семейства подковоносовых (Rhinolophidae). В новой работе, опубликованной в Scientific Reports, описан еще один представитель сарбековирусов, заражающего подковоносов — RhGB01.
Вирус был найден в ходе метагеномного анализа фекальных образцов малого подковоноса Rhinolophus hipposideros, собранных на территории Великобритании (западной границе ареала обитания подковоносов) в августе и сентябре 2020 года. После секвенирования и сборки генома RhGB01 ученые приступили к анализу гомологии рецептор-связывающих доменов (RBD) S-белков нового вируса, SARS-CoV-2 и SARS-CoV. Также авторы восстановили трехмерную структуру RBD вируса RhGB01.
Ученые собрали контиг длиной 29 тысяч пар оснований, который содержит десять генов, в то время как SARS-CoV-2 и SARS-CoV имеют 11 генов. Филогенетический анализ на основе последовательностей генов, кодирующих S-белок и РНК-зависимую РНК-полимеразу, показал, что RhGB01 образует монофилетическую кладу с сарбековирусом BM48-31/BGR/2008, обнаруженным у подковоноса Rhinolophus blasii в Болгарии. В то же время на основании анализа последовательностей 3C-подобной протеазы, хеликазы и эндорибонуклеазы новый вирус попадает в одну кладу с SARS-CoV и SARS-CoV-2.
По аминокислотной последовательности RBD S-белка (за исключением рецептор-связывающего мотива) новый вирус на 77% и 81% гомологичен SARS-CoV-2 и SARS-CoV соответственно. Однако строение этого участка у RhGB01 отличается от таковых у SARS-CoV-2 и SARS-CoV по ряду ключевых остатков, необходимых для взаимодействия с человеческим рецептором ACE2. Поэтому без приобретения дополнительных мутаций RhGB01 неспособен заражать человека. Авторы исследования уверены, что на данный момент новый вирус опасности не представляет, поэтому нужды в разработке вакцины от него пока нет.
Выявлен новый сарбековирус!
Ученые открыли новый сарбековирус RhGB01 после исследования всего 53 образцов фекалий подковообразных летучих мышей, расширив географические и видовые диапазоны коронавирусов, подобных SARS-CoV и SARS-CoV-2, сообщает naked-science.
Предположительно, они будут встречаться на всем ареале летучих мышей — от Австралии и Японии до Европы и Африки.
Источник нынешней вспышки коронавируса все еще неизвестен, несмотря на тысячи исследований, доклады ВОЗ, расследования и прочее. Естественными хозяевами как SARS-CoV (тяжелый острый респираторный синдром, возникший в 2002 году), так и нашего SARS-CoV-2 считаются летучие мыши-подковоносы (Rhinolophus), а вот промежуточного носителя, передавшего вирус человеку, не установили.
Ареал летучих мышей охватывает большую часть Старого Света, но основную часть проб ранее брали в Восточной и Юго-Восточной Азии, где около 50 коронавирусов, родственных SARS, нашли у десяти видов рукокрылых, 48 из них принадлежат девяти разным подковоносам. Филогенетический анализ новых сарбековирусов — то есть коронавирусов, связанных с атипичной пневмонией — подковообразных в Китае показал, что они больше всего тесно связаны именно с SARS-CoV и SARS-CoV-2.
Ученые из Университета Восточной Англии решили дополнить эти данные. Авторы исследования, опубликованного накануне в журнале Scientific Reports, собирали фекалии десятков мелких подковообразных в Сомерсете, Монмутшире и Уэльсе в августе и сентябре 2020 года. Фекалии помещали в индивидуальные стерильные пробирки, содержащие раствор для стабилизации РНК, охлаждали и хранили в замороженном виде перед анализом. Секвенирование генома выявило ранее неизвестный вирус в одном из 53 образцов. Он получил название RhGB01. Вирус содержит 10 кодирующих генов, тогда как SARS-CoV и SARS-CoV-2 — 11 кодирующих генов с включением белка ORF8.
Стоит подчеркнуть, что эксперты не предоставили никаких доказательств того, что обнаруженный вирус был передан человеку или, что он может стать таковым в будущем.
Найдены невосприимчивые к коронавирусу люди
Ученые США и Швейцарии нашли антитела, нейтрализующие SARS-CoV-2, в организме людей, переболевших SARS в 2003 году. О случае перекрестного иммунитета к коронавирусам, вызывающим тяжелый острый респираторный синдром, сообщается в статье, опубликованной в журнале Nature.
Исследователи выяснили, что заражение вирусом SARS-CoV, ставшим причиной вспышки атипичной пневмонии 17 лет назад, вызывает выработку различных антител, нацеленных на белок-«шип» (S-белок). S-белок играет ключевую роль в связывании коронавируса с рецепторами на поверхности клетки-хозяина, после чего вирус проникает внутрь. Антитела синтезируются особой разновидностью клеток иммунной системы, называемой B-клетками памяти.
Как показали эксперименты, одна из разновидностей вырабатываемых антител — S309 — эффективно нейтрализуют псевдовирусы (биологически безопасные рекомбинантные вирусы) SARS-CoV-2 и SARS-CoV, а также вирус SARS-CoV-2 через распознавание того участка (домена) S-белка, что непосредственно взаимодействует с клеточными рецепторами. Оба коронавируса относятся к подроду сарбековирусов и имеют идентичные эпитопы — части S-белка, на которые нацелены антитела. Таким образом, люди, зараженные одним коронавирусом, оказываются невосприимчивыми к другому.
Как пишут авторы в статье, содержащие S309 смеси антител, синтезируемых B-клетками памяти после заражения SARS-CoV, усиливают нейтрализацию нового коронавируса и препятствуют появлению мутантов, обладающих устойчивостью к приобретенной иммунной реакции. Такие коктейли из антител могут быть использованы для лечения тяжелых осложнений у пациентов с COVID-19 или профилактики инфекции у людей с высоким риском заражения.
Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
СОДЕРЖАНИЕ
Классификация [ править ]
Геном [ править ]
Морфология [ править ]
Морфология коронавируса, связанного с атипичной пневмонией, характерна для семейства коронавирусов в целом. Вирусы представляют собой большие плеоморфные сферические частицы с выпуклыми выступами на поверхности, которые на электронных микрофотографиях образуют корону вокруг частиц. [26] Размер вирусных частиц находится в диапазоне 80–90 нм. Оболочка вируса на электронных микрофотографиях выглядит как отдельная пара электронно-плотных оболочек. [27]
30 т.п.н. ) РНК в виде непрерывных шариков-на-а- соответствие строкового типа. [31] [32] Липидная двуслойная оболочка, мембранные белки и нуклеокапсид защищают вирус, когда он находится вне хозяина. [33]
Жизненный цикл [ править ]
Коронавирус, связанный с SARS, следует стратегии репликации, типичной для всех коронавирусов. [19] [34]
Приложение и запись
Присоединение связанного с SARS коронавируса к клетке-хозяину опосредуется белком-спайком и его рецептором. [35] Связывающий домен рецептора шипового белка (RBD) распознает и прикрепляется к рецептору ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2). [4] После прикрепления вирус может проникнуть в клетку-хозяина двумя разными путями. Путь, по которому идет вирус, зависит от протеазы хозяина, способной расщеплять и активировать прикрепленный к рецептору спайковый белок. [36]
Альтернативно, вирус может проникать в клетку-хозяин непосредственно путем протеолитического расщепления прикрепленного к рецептору шипового белка сериновыми протеазами TMPRSS2 или TMPRSS11D хозяина на поверхности клетки. [37] [38] В коронавирусе SARS активация С-концевой части белка-шипа запускает слияние вирусной оболочки с мембраной клетки-хозяина, вызывая конформационные изменения, которые до конца не изучены. [39]
Перевод генома
Репликация и транскрипция
Ряд белков неструктурной репликации сливаются с образованием мультибелкового комплекса репликаза-транскриптаза (RTC). [42] Основным белком репликаза-транскриптаза является РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp). Он непосредственно участвует в репликации и транскрипции РНК из цепи РНК. Другие неструктурные белки в комплексе участвуют в процессах репликации и транскрипции. [40]
Другой важной функцией комплекса репликаза-транскриптаза является репликация вирусного генома. RdRp непосредственно опосредует синтез геномной РНК с отрицательным смыслом из геномной РНК с положительным смыслом. За этим следует репликация геномной РНК с положительным смыслом из геномной РНК с отрицательным смыслом. [45]
Рекомбинация
Сборка и выпуск
Потомки вирусов высвобождаются из клетки-хозяина путем экзоцитоза через секреторные везикулы. [49]